Seiya Kanie, un lycéen intelligent et extrêmement narcissique, croit que la belle mais réservée Isuzu Sento l'a invité à un rendez-vous dans un parc d'attractions appelé Amagi Brilliant Park. À son grand dam, non seulement l'endroit est délabré, mais le prétendu rendez-vous n'est qu'une visite de recrutement où Sento et la princesse Latifa Fleuranza, propriétaire du parc à thème, lui demandent de devenir le nouveau directeur du parc. Leur motif de désespoir ? Comme le stipule un contrat d'utilisation du terrain, Amagi a moins de trois mois pour atteindre un quota de 500 000 visiteurs, faute de quoi le parc sera définitivement fermé et le terrain réaménagé par une société immobilière cupide. Seiya est conquis par la révélation qu'Amagi n'est pas un parc d'attractions ordinaire ; beaucoup de ses employés sont des Maple Landers, des êtres magiques mystérieux qui vivent dans le monde des humains et se nourrissent de l'énergie créée par les gens qui s'amusent. Seiya, qui s'est vu confier les espoirs et les rêves de ce lointain pays enchanté, doit maintenant utiliser ses nombreuses compétences pour remettre Amagi sur pied, ou le voir s'effondrer sous ses yeux.

Isuzu Sento oblige Seiya Kanie, sous la menace d'une arme, à sortir avec elle. Le lieu de rendez-vous s'avère être le parc Amagi Brilliant. En parcourant le parc, Isuzu présente à Seiya les différentes attractions, et il est évident qu'elles sont toutes très insatisfaisantes. Après avoir fait le tour du parc, Isuzu demande à Seiya ce qu'il pense de l'endroit, ce à quoi il répond très négativement, s'exclamant finalement : "Il faut croire soi-même en un rêve pour que les autres y croient !". Alors qu'il s'apprête à partir, Isuzu lui offre des croquettes, qui se révèlent délicieuses. Décidé à savoir qui les a faites, Seiya suit Isuzu pour rencontrer la directrice du Parc, Latifa Fleuranza. Elle explique que les acteurs du parc sont en fait des habitants d'un pays magique, et que s'ils ne parviennent pas à attirer suffisamment de clients en un temps donné, le parc sera fermé. Elle demande à Seiya de l'aider en prenant le poste de directeur. Elle lui dit également qu'elle lui donnera des pouvoirs magiques.

Pas assez de visiteurs !

Le lendemain, Seiya se rend compte qu'il a le pouvoir de lire dans les pensées des gens. Isuzu l'emmène à nouveau au parc, où ils rencontrent des gens d'Amagi Development ; ce sont eux qui prendront le contrôle du parc une fois le temps écoulé. L'un d'entre eux reconnaît Seiya et lui dit de ne pas s'approcher des perdants du parc, sous peine de devenir lui aussi un perdant. Dans le Parc, une assemblée se tient, où la Princesse, Latifa Fleuranza, annonce que le Parc sera fermé dans trois mois. Seiya revient vers eux et leur annonce qu'il va les sauver. Mais plus tard, lorsqu'il se retrouve seul avec Isuzu et Latifa, il dit qu'il a juste prétendu cela pour remonter le moral de tout le monde, mais qu'il n'est pas vraiment confiant à ce sujet - mais Latifa affirme qu'elle a une foi totale en lui.

Pas assez de temps !

Seiya annonce aux employés que le parc sera fermé pendant une journée en raison de travaux de réparation. Il annonce ensuite trois changements : le parc fermera à 19 heures, annulera le jour de congé du vendredi et instaurera un paiement de 30 yens pour tous les services. Lorsque Moffle frappe un client gênant, Isuzu tire sur le client et sa famille avec des balles qui provoquent une perte de mémoire. Salama enregistre le combat avec son téléphone portable. Seiya enregistre une vidéo promotionnelle avec les fées Elementario, Latifa et Isuzu en maillot de bain, mais elle n'obtient pas autant de vues que prévu. Il met alors en ligne une vidéo modifiée du combat, qui obtient de nombreuses visites et, par conséquent, beaucoup de vues par rapport à la vidéo promotionnelle mise en ligne au préalable.

Pas assez de renforcement !

Grâce à la gestion sans faille de Seiya, l'efficacité du parc et le nombre de visiteurs augmentent, et lorsque Isuzu l'informe que Moffle, Macaron et Tiramie ont des plaintes à formuler, il décide de la laisser s'en occuper, mais les Fées Elementario lui montrent qu'au lieu de chercher un compromis, Isuzu met fin à la discussion en les menaçant avec son arme à feu. Seiya gronde alors Isuzu pour son comportement, ce qui crée un fossé entre eux. Le lendemain, Latifa demande à Seiya de faire un tour de grande roue avec elle et, à cette occasion, il est révélé qu'il a le vertige, et lorsqu'elle le réconforte, Seiya a l'impression qu'ils se sont déjà rencontrés. Quelque temps plus tard, il commence à pleuvoir, et comme le système de drainage est cassé, menaçant d'inonder tout le parc, Isuzu prend les devants et organise une opération d'urgence pour éviter d'autres dégâts. Après la pluie, Isuzu révèle que son comportement strict envers les autres est dû à sa formation militaire, et croit que tout le monde dans le parc la déteste à cause de cela, mais Seiya lui montre les visages heureux des acteurs qui la remercient pour son aide, lui prouvant ainsi qu'elle a tort.

Pas assez de productivité pour l'AP !

Le parc Amagi Brilliant a utilisé toutes ses économies et il n'y a plus d'argent pour le faire fonctionner. Cependant, Moffle se souvient de leur ami Dornell, qui a disparu après avoir cherché un trésor dans une zone abandonnée du parc. Seiya, Isuzu, Macaron, Tiramie et Moffle partent donc enquêter. Isuzu et Macaron sont séparés des autres et découvrent que Dornell était caché dans la grotte pendant tout ce temps, s'adonnant à plusieurs passe-temps, tandis que Seiya et les autres affrontent Rubrum, le dragon rouge, et apprennent que Rubrum et les Diggeries, un groupe de fées ressemblant à des taupes, fuyaient un empire tyrannique et ont trouvé refuge dans le parc. De retour à la surface, Rubrum et les Diggeries demandent à travailler dans le parc, ce que Seiya accepte, tandis que tous les objets rassemblés par Dornell pendant son absence sont vendus pour payer les dépenses du parc.

Pas assez d'argent !

Le parc manquant de personnel, Seiya décide d'organiser un entretien d'embauche pour de nouveaux employés et Isuzu se met dans un sérieux pétrin lorsqu'elle mange contre son gré un fruit qui l'oblige à toujours dire ce qu'elle pense, la laissant dans la crainte de révéler ses véritables sentiments pour lui. Ses problèmes s'aggravent lorsque trois des candidates sont celles qu'elle a vues en rêve la nuit précédente, ce qui lui fait penser qu'elles vont soit séduire Seiya, soit la remplacer en tant qu'assistante et secrétaire.

Pas assez de monde !

Le parc est en état d'alerte lorsqu'un groupe de pirates du Pays de l'érable apparaît pour semer le chaos. Avec Isusu, Latifah, Moffle, Macaron et les fées Elementario sous leur garde, c'est à Seiya et aux autres de s'opposer aux pirates et de les sauver. Le tout sans que les invités ne se rendent compte qu'il ne s'agit pas d'une comédie.

Pas assez de sécurité dans les piscines !

Seiya attrape un rhume d'été, mais il ne peut pas se permettre de sécher l'école en raison de ses absences antérieures. Sento, Macaron, Tiramie et Moffle portent un costume réaliste de son corps une personne par jour et vont à l'école à sa place. Le premier jour, Isuzu trouve une lettre d'amour dans le casier à chaussures de Kanie, mais l'expéditeur, Tsuchida Kanae, avait simplement confondu son casier avec celui de quelqu'un d'autre. Sento lui dit des mots inspirants et Kanae finit par développer des sentiments pour Kanie. Les deux jours suivants se terminent par des incidents dégoûtants dus au comportement des mascottes, tandis que le quatrième jour se termine paisiblement grâce à Kanie qui porte le costume d'un garçon à qui Kanae avait essayé d'envoyer la lettre à l'origine, Kimura, et qui ment en disant que tous les actes dégoûtants de "Kanie" les jours précédents étaient destinés à ramener Kanae à Kimura en lui faisant haïr Kanie.

Pas assez d'amour !

N'ayant pas progressé dans leur attraction à cause de leur manque de travail d'équipe, les Fées Elementario sont invitées à dîner avec Latifah et activent involontairement le système de défense du château. Piégées dans le château, les fées doivent réinitialiser le système de l'intérieur, mais pour cela, elles doivent passer une série d'épreuves qui les obligent à travailler ensemble.

Pas assez de travail d'équipe !

Tout le monde fait de son mieux, mais il semble impossible d'atteindre l'objectif de 250 000 visiteurs. Isuzu explique à Kanie pourquoi Latifah s'évanouit si souvent. Il s'avère qu'une malédiction drainant l'Animus pèse sur la princesse. Le parc Amagi Brilliant a été construit pour maintenir Latifah en vie. Seiya se souvient de sa rencontre avec la princesse lorsqu'il était jeune, mais elle n'avait pas changé d'aspect. Moffle lui explique que la malédiction n'affecte pas seulement la santé de la princesse, mais qu'elle réinitialise également ses souvenirs et son développement physique chaque année. À dix jours de l'échéance, Seiya apprend de Triken qu'il a trouvé ce qu'il lui avait demandé de chercher, ce qui lui redonne espoir.

Il n'y a rien à faire !

Le plan de Seiya pour atteindre le quota en 10 jours consiste à organiser un match de football dans le stade du parc. Après avoir convaincu l'équipe de football locale de jouer un match important dans le parc, Seiya informe les acteurs que pour que leur plan fonctionne, une grande zone inutilisée du parc doit être vendue afin de payer les dépenses et de résoudre leurs problèmes financiers, ce qu'ils acceptent. Ils passent ensuite les jours suivants à préparer le match, tandis que Seiya est toujours inquiet, sachant que le dernier jour, les souvenirs de Latifah seront réinitialisés et qu'elle l'oubliera une fois de plus. Le dernier jour arrive enfin, et alors que tous les visiteurs ont été comptés et qu'il ne reste plus que quelques heures avant la date limite, Seiya est choqué d'apprendre qu'il ne leur manque que 252 visiteurs pour atteindre l'objectif.

Il n'y a plus de raison de s'inquiéter !

En dernier recours, les employés du parc Amagi Brilliant invitent tous leurs amis et parents, atteignant ainsi le quota en un rien de temps. Annonçant que c'est son dernier jour en tant que directeur, Seiya révèle aux autres qu'un immense centre commercial sera créé sur le terrain qu'il a vendu précédemment, ce qui contribuera à attirer des visiteurs dans le parc. Takaya Kurisu, de l'Amagi Development, félicite Seiya pour son exploit, mais se moque également de lui car le problème de l'état de Latifah n'a pas encore été résolu, se révélant être le sorcier qui l'a maudite avant de s'enfuir. Cependant, à minuit, Seiya et les autres découvrent que l'énorme quantité d'Animus recueillie au cours des dernières semaines a été suffisante pour libérer Latifah de sa malédiction, à la grande joie de tout le monde. Seiya fait alors ses adieux aux habitants du parc, mais lorsqu'il rentre chez lui, sa tante Aisu Kyuubu lui fait remarquer à quel point il était heureux lorsqu'il travaillait là-bas. Le lendemain, Seiya revient et reprend son poste de directeur du parc Amagi Brilliant, affirmant qu'il lui reste encore beaucoup de choses à faire.